17.41. test_gpr

Test functions of cobra.core.gene.GPR .

17.41.1. Module Contents

17.41.1.1. Functions

test_gpr()

test_empty_gpr(test_input) → None

test_one_gene_gpr()

powerset_ne(iterable)

powerset_ne([1,2,3]) –> (1,) (2,) (3,) (1,2) (1,3) (2,3) (1,2,3)

test_and_gpr(gpr_input, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string)

all_except_one(iterable)

all_except_one([1,2,3]) –> (1,) (2,) (3,) (1,2) (1,3) (2,3)

test_or_gpr(gpr_input, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string)

test_complicated_gpr(gpr_input)

test_gpr_from_ast_or(string_to_ast, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string) → None

test_gpr_from_ast_and(string_to_ast, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string) → None

test_wrong_input_gpr_error(test_input)

test_wrong_input_gpr_warning(test_input)

test_deprecated_gpr()

test_gpr.test_gpr()[source]
test_gpr.test_empty_gpr(test_input) → None[source]
test_gpr.test_one_gene_gpr()[source]
test_gpr.powerset_ne(iterable)[source]

powerset_ne([1,2,3]) –> (1,) (2,) (3,) (1,2) (1,3) (2,3) (1,2,3)

test_gpr.test_and_gpr(gpr_input, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string)[source]
test_gpr.all_except_one(iterable)[source]

all_except_one([1,2,3]) –> (1,) (2,) (3,) (1,2) (1,3) (2,3)

test_gpr.test_or_gpr(gpr_input, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string)[source]
test_gpr.test_complicated_gpr(gpr_input)[source]
test_gpr.test_gpr_from_ast_or(string_to_ast, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string) → None[source]
test_gpr.test_gpr_from_ast_and(string_to_ast, num_genes, gpr_genes, gpr_output_string) → None[source]
test_gpr.test_wrong_input_gpr_error(test_input)[source]
test_gpr.test_wrong_input_gpr_warning(test_input)[source]
test_gpr.test_deprecated_gpr()[source]